经济快捷的SNP位点研究方法-SNP基因分型

SNP，全称 Single Nucleotide Polymorphisms，是指在基因组上单个核苷酸的变异。目前很多人仍然使用测序法来进行研究，具有准确、直观的优点。但有一种方法，能间接的研究SNP，且经济快捷，那就是——SNP基因分型。

其实现原理：熔解温度（melting temperature,Tm）是指吸光值增加到最大值的一半时的温度称为DNA的解链温度或熔点。当实时荧光定量PCR中的荧光探针与靶基因错配，即靶基因序列上产生了核苷酸变异，他们的熔解温度比较低。相对而言，没有突变的靶基因与探针杂交的熔解温度较高。通过区分熔解温度的差异，来区分突变型和未突变型（野生型）。

进行SNP基因分型需要注意：

1、将突变的位点放在探针中间。

2、保证两条探针的熔解温度相同。

荧光探针中，Taqman探针可进行SNP基因分型。推荐Applied Biosystems公司的Taqman MGB探针，相对普通Taqman探针，与错配序列的熔解温度相差更大。

分子信标也可用于SNP基因分型。他的茎环结构比一般线性的分子探针更适合SNP分型，茎环结构与错配序列杂交的热稳定性更低，熔解温度相差也更大。

读者们可根据自己的实验需求，选择合适的方法进行分析。