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如何从培养细胞中制备细胞核基质/中间纤维骨架结构?
发布时间: 2021-11-18 点击次数: 806次材料与仪器
细胞
Tritron X-100 抽提缓冲液
电子显微镜步骤
1. 在 4℃ 用 PBS 洗细胞一次。
2. 在 4℃ 用含 0.5% Tritron X-100 的细胞骨架缓冲液抽提细胞 3 到 5 分钟。直到消化步骤,每 107 个细胞最少要用 1 ml 缓冲液,以后减半。
3. 在 4℃ 用抽提缓冲液抽提细胞 3~5 分钟。这一步去除组蛋白 H1 和除中间纤维蛋白之外的细胞骨架蛋白。另外,这一步也可在 DNA 酶消化步骤(第 4 步)之后作,这样也不会引起超微结构的变化。
抽提缓冲液:
10 mmol/L PIPES,pH 6.8
250 mmol/L 硫酸铵
300 mmol/L 蔗糖
3 mmol/L MgCl2
1 mmol/L EDTA
4. 在含 0.5% Triton X-100 的消化缓冲液中用无 RNA 酶的 DNA 酶消化以去除染色质 DNA 酶浓度为 200~400 单位/ml,32℃ 反应 30~50 分钟。
含 0.5% Triton X-100 的消化缓冲液:
10 mmol/L PIPES,pH 6.8
300 mmol/L 蔗糖
50 mmol/L NaCl
3 mmol/L MgCl2
1 mmol/L EGTA
5. 用抽提缓冲液清洗样品两次,每次 5 分钟。
6. (可选)样品在 4℃ 用 2 mol/L NaCl 抽提 3~5 分钟。这一步能使可能形成核基质核心的 10 nm 纤丝分支显形(Jackson and Cook 1988; He et al, 1990)。在第 4 步中用 Hae Ⅲ 和 Pst Ⅰ(每种酶 400 单位/ml)代替 DNA 酶 Ⅰ 可以使核心纤丝保存的更好。
2 mol/L NaCl 缓冲液:
10 mmol/L PIPES,pH 6.8
300 mmol/L 蔗糖
2 mol/L NaCl
3 mmol/L MgCl2
1 mmol/L EGTA
7. 固定核基质以进行免疫荧光检测或电子显微镜检测。